Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V5

Hdac6, Histone deacetylase 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac6Q9Z2V5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Hdac6Q9Z2V5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Hdac6Q9Z2V5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Hdac6Q9Z2V5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Hdac6Q9Z2V5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms