Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Epb41l1Q9Z2H5 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Epb41l1Q9Z2H5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Epb41l1Q9Z2H5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Epb41l1Q9Z2H5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms