Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trip6Q9Z1Y4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trip6Q9Z1Y4 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trip6Q9Z1Y4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trip6Q9Z1Y4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trip6Q9Z1Y4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms