Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N7

Arid3b, AT-rich interactive domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3bQ9Z1N7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Arid3bQ9Z1N7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Arid3bQ9Z1N7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Arid3bQ9Z1N7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Arid3bQ9Z1N7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms