Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PIAS3Q9Y6X2 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PIAS3Q9Y6X2 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PIAS3Q9Y6X2 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PIAS3Q9Y6X2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms