Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RPS6KL1Q9Y6S9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPS6KL1Q9Y6S9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPS6KL1Q9Y6S9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms