Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R9

CCDC61, Coiled-coil domain-containing protein 61, humanhuman

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC61Q9Y6R9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
CCDC61Q9Y6R9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CCDC61Q9Y6R9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CCDC61Q9Y6R9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CCDC61Q9Y6R9 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.3 ms