Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC37.65■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
MAP3K4Q9Y6R4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC37.62■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC37.59■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC37.56■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
MAP3K4Q9Y6R4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC37.46■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
MAP3K4Q9Y6R4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.44■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC37.43■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC37.41■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
MAP3K4Q9Y6R4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms