Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LRRC42Q9Y546 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LRRC42Q9Y546 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LRRC42Q9Y546 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 184.4 ms