Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4F1

FARP1, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,045 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP1Q9Y4F1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FARP1Q9Y4F1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FARP1Q9Y4F1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FARP1Q9Y4F1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms