Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D7

PLXND1, Plexin-D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXND1Q9Y4D7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PLXND1Q9Y4D7 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLXND1Q9Y4D7 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLXND1Q9Y4D7 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms