Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ATP8A1Q9Y2Q0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ATP8A1Q9Y2Q0 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ATP8A1Q9Y2Q0 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ATP8A1Q9Y2Q0 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms