Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PapolbQ9WVP6 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PapolbQ9WVP6 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PapolbQ9WVP6 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PapolbQ9WVP6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms