Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUK4

Rfc2, Replication factor C subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc2Q9WUK4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rfc2Q9WUK4 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rfc2Q9WUK4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rfc2Q9WUK4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rfc2Q9WUK4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.4 ms