Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUF1

Vmn1r49, Vomeronasal type-1 receptor 49, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r49Q9WUF1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r49Q9WUF1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Vmn1r49Q9WUF1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r49Q9WUF1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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