Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SORCS3Q9UPU3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SORCS3Q9UPU3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SORCS3Q9UPU3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101 ms