Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CDH7Q9ULB5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CDH7Q9ULB5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CDH7Q9ULB5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms