Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GJD2Q9UKL4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.54■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
GJD2Q9UKL4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJD2Q9UKL4 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD2Q9UKL4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms