Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NDUFA12Q9UI09 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NDUFA12Q9UI09 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NDUFA12Q9UI09 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms