Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC36.55■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC36.51■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
MLH3Q9UHC1 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.45■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
MLH3Q9UHC1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.42■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
MLH3Q9UHC1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.35■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
MLH3Q9UHC1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
MLH3Q9UHC1 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms