Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TCF20Q9UGU0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TCF20Q9UGU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TCF20Q9UGU0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TCF20Q9UGU0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms