Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.63■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
IFT172Q9UG01 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
IFT172Q9UG01 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
IFT172Q9UG01 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
IFT172Q9UG01 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms