Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CNOT8Q9UFF9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNOT8Q9UFF9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNOT8Q9UFF9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms