Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
MBD2Q9UBB5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
MBD2Q9UBB5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
MBD2Q9UBB5 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms