Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Psma4Q9R1P0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Psma4Q9R1P0 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Psma4Q9R1P0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psma4Q9R1P0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms