Protein–RNA interactions for Protein: Q9R194

Cry2, Cryptochrome-2, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cry2Q9R194 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Cry2Q9R194 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cry2Q9R194 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cry2Q9R194 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Cry2Q9R194 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms