Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
NrkQ9R0G8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC35.67■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
NrkQ9R0G8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC35.62■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
NrkQ9R0G8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
NrkQ9R0G8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NrkQ9R0G8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC35.42■■■■□ 3.26
NrkQ9R0G8 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms