Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Wdr54Q9R0D8 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Wdr54Q9R0D8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Wdr54Q9R0D8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdr54Q9R0D8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms