Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0A1

Clcn2, Chloride channel protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn2Q9R0A1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clcn2Q9R0A1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clcn2Q9R0A1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clcn2Q9R0A1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms