Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trpc3Q9QZC1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trpc3Q9QZC1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trpc3Q9QZC1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trpc3Q9QZC1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms