Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Snai3Q9QY31 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Snai3Q9QY31 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms