Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Foxe3Q9QY14 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Foxe3Q9QY14 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Foxe3Q9QY14 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Foxe3Q9QY14 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8 ms