Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUJ7

Acsl4, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 4, mousemouse

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl4Q9QUJ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Acsl4Q9QUJ7 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Acsl4Q9QUJ7 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Acsl4Q9QUJ7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms