Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ9

TMOD4, Tropomodulin-4, humanhuman

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD4Q9NZQ9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
TMOD4Q9NZQ9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TMOD4Q9NZQ9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.08
TMOD4Q9NZQ9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TMOD4Q9NZQ9 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms