Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZJ4

SACS, Sacsin, humanhuman

Predictions only

Length 4,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SACSQ9NZJ4 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
SACSQ9NZJ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SACSQ9NZJ4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SACSQ9NZJ4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms