Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TVP23BQ9NYZ1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
TVP23BQ9NYZ1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TVP23BQ9NYZ1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms