Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DLL3Q9NYJ7 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
DLL3Q9NYJ7 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
DLL3Q9NYJ7 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms