Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX61

TMEM161A, Transmembrane protein 161A, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM161AQ9NX61 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
TMEM161AQ9NX61 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TMEM161AQ9NX61 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TMEM161AQ9NX61 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TMEM161AQ9NX61 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms