Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
DNAJC17Q9NVM6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
DNAJC17Q9NVM6 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
DNAJC17Q9NVM6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
DNAJC17Q9NVM6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms