Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SMC4Q9NTJ3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SMC4Q9NTJ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SMC4Q9NTJ3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.73■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
SMC4Q9NTJ3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms