Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PNPLA3Q9NST1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PNPLA3Q9NST1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PNPLA3Q9NST1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.1 ms