Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSE4

IARS2, Isoleucine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IARS2Q9NSE4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IARS2Q9NSE4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IARS2Q9NSE4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
IARS2Q9NSE4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IARS2Q9NSE4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IARS2Q9NSE4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IARS2Q9NSE4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IARS2Q9NSE4 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IARS2Q9NSE4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IARS2Q9NSE4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IARS2Q9NSE4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms