Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
CTNNBIP1Q9NSA3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CTNNBIP1Q9NSA3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms