Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLBQ9NRJ5 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLBQ9NRJ5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PAPOLBQ9NRJ5 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLBQ9NRJ5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PAPOLBQ9NRJ5 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PAPOLBQ9NRJ5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PAPOLBQ9NRJ5 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PAPOLBQ9NRJ5 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.1 ms