Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC33.17■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CD163L1Q9NR16 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
CD163L1Q9NR16 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.88
CD163L1Q9NR16 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CD163L1Q9NR16 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CD163L1Q9NR16 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms