Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV8

PRDM8, PR domain zinc finger protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM8Q9NQV8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
PRDM8Q9NQV8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRDM8Q9NQV8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PRDM8Q9NQV8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PRDM8Q9NQV8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms