Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQG5

RPRD1B, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1BQ9NQG5 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RPRD1BQ9NQG5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RPRD1BQ9NQG5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RPRD1BQ9NQG5 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms