Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC3

RTN4, Reticulon-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN4Q9NQC3 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RTN4Q9NQC3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RTN4Q9NQC3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
RTN4Q9NQC3 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RTN4Q9NQC3 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.2 ms