Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Col5a3Q9JLI2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Col5a3Q9JLI2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col5a3Q9JLI2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col5a3Q9JLI2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms