Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL35

Hmgn5, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn5Q9JL35 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Hmgn5Q9JL35 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hmgn5Q9JL35 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hmgn5Q9JL35 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hmgn5Q9JL35 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms